Zgodnie z art. 107 Ustawy o ochronie przyrody (Dz.U. 2004 Nr 92 poz. 880 ze zm.) do zadań Służby Parku Krajobrazowego należy m.in. realizacja zadań związanych z ochroną innych form ochrony przyrody w granicach parku krajobrazowego.
Na obszarze Zaborskiego Parku Krajobrazowego zlokalizowane są następujące formy ochrony:
- rezerwaty przyrody;
- obszary Natura 2000;
- użytki ekologiczne;
- pomniki przyrody.